Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
teaching:2019winter:applcompgenomics [2019/09/20 07:23]
rwittler [Table]
teaching:2019winter:applcompgenomics [2020/09/14 08:26] (current)
rwittler
Line 15: Line 15:
 ... can be found in [[https://​github.com/​cchauve/​Bielefeld-block-seminar-on-Applied-Comparative-Genomics|this github repository]]. ... can be found in [[https://​github.com/​cchauve/​Bielefeld-block-seminar-on-Applied-Comparative-Genomics|this github repository]].
  
-===== Schedule ​(draft) ​=====+===== Schedule =====
  
-^ First block                                                                        |||| +^ First block (16.–27.09.2019) ​                                                                       ​|||| 
-| Mon          | 16.09. ​ | 10-12h ​  | Overview: The genomes of 16 Anopheles mosquitoes ​ | +| Mon                           ​| 16.09. ​ | 10-12h ​  | Overview: The genomes of 16 Anopheles mosquitoes ​ | 
-| Tue          | 17.09. ​ | 10-12h ​  | Data quality ​                                     | +| Tue                           ​| 17.09. ​ | 10-12h ​  | Data quality ​                                     | 
-| Wed          | 18.09. ​ | 10-12h ​  | The //gambiae// phylogeny ​                        | +| Wed                           ​| 18.09. ​ | 10-12h ​  | The //gambiae// phylogeny ​                        | 
-| Thu          | 19.09. ​ | 10-12h ​  | Use synteny for gene family analysis ​             | +| Thu                           ​| 19.09. ​ | 10-12h ​  | Use synteny for gene family analysis ​             | 
-| Fri          | 20.09. ​ | 10-12h ​  | Open reading ​                                     | +| Fri                           ​| 20.09. ​ | 10-12h ​  | Open reading ​                                     | 
-                                                                                   |||| +                                                                                                    ​|||| 
-| Mon          | 23.09. ​ | 10-12h ​  | Open reading ​                                     | +| Mon                           ​| 23.09. ​ | 10-12h ​  | Open reading ​                                     | 
-| Tue          | 24.09. ​ | 10-12h ​  ​| ​Andreas: OrthoDB (BUSCO) ​                         ​+| Tue                           ​| 24.09. ​ | 10-12h ​  ​| ​Gene-tree species-tree reconciliation ​            
-| Wed          | 25.09. ​ | 10-12h ​  | Fabian: Synteny blocks ​                           | +| Wed                           ​| 25.09. ​ | 10-12h ​  | Fabian: Synteny blocks ​                           | 
-| Thu          | 26.09. ​ | 10-12h ​  | Jan: Improving Scaffolding ​                       | +| Thu                           ​| 26.09. ​ | 10-12h ​  | Jan: Improving Scaffolding ​                       ​
-|  .                    ||  13-15h ​ | Gene-tree species-tree reconciliation ​            +|                                                  ||| Andreas: OrthoDB (BUSCO) ​                         ​
-| Fri          | 27.09. ​ | ---      |                                                   |+|  .                                     ​||  13-15h ​ | Feedback ​                                         ​
 +| Fri                           ​| 27.09. ​ | ---      |                                                   |
  
-^ Second block ^^^^ +^ Second block (10.–14.02.2020) ​                                                                               |||| 
-|Mon| 10.02.| 10-12h | | +| Mon                            | 10.02. ​ | 10-12h ​ The genome rearrangement landscape ​                        
-|Tue| 11.02.| 10-12h | | +| Tue                            | 11.02. ​ | 10-12h ​ Handling duplications / Small parsimony problem (SPP)      ​
-|Wed| 12.02.| 10-12h | | +| Wed                            | 12.02. ​ | 10-12h ​ Ancestral gene orders in a model-free framework ​           ​
-|Thu| 13.02.| 10-12 and 13-15h | +| Thu                            | 13.02. ​ | 10-12h  | Joint scaffolding ​and ancestral gene order reconstruction  ​
-|Fri| 14.02.| --- | |+| Fri                            | 14.02. ​ 10-12h  ​Student talks                                              ​|
  
  
teaching/2019winter/applcompgenomics.1568964225.txt.gz · Last modified: 2019/09/20 07:23 by rwittler