Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
teaching:2019winter:applcompgenomics [2019/09/19 08:19]
rwittler [Schedule (draft)]
teaching:2019winter:applcompgenomics [2020/09/14 08:26]
rwittler
Line 15: Line 15:
 ... can be found in [[https://​github.com/​cchauve/​Bielefeld-block-seminar-on-Applied-Comparative-Genomics|this github repository]]. ... can be found in [[https://​github.com/​cchauve/​Bielefeld-block-seminar-on-Applied-Comparative-Genomics|this github repository]].
  
-===== Schedule ​(draft) ​=====+===== Schedule =====
  
-^ First block                                                                                 ​|||| +^ First block (16.–27.09.2019) ​                                                                       ​|||| 
-| Mon          | 16.09. ​ | 10-12h ​           | Overview: The genomes of 16 Anopheles mosquitoes ​ | +| Mon                           ​| 16.09. ​ | 10-12h ​  ​| Overview: The genomes of 16 Anopheles mosquitoes ​ | 
-| Tue          | 17.09. ​ | 10-12h ​           | Data quality ​                                     | +| Tue                           ​| 17.09. ​ | 10-12h ​  ​| Data quality ​                                     | 
-| Wed          | 18.09. ​ | 10-12h ​           | The //gambiae// phylogeny ​                        | +| Wed                           ​| 18.09. ​ | 10-12h ​  ​| The //gambiae// phylogeny ​                        | 
-| Thu          | 19.09. ​ | 10-12h ​           | Use synteny for gene family analysis ​             | +| Thu                           ​| 19.09. ​ | 10-12h ​  ​| Use synteny for gene family analysis ​             | 
-| Fri          | 20.09. ​ | 10-12h ​           | Open reading ​                                     | +| Fri                           ​| 20.09. ​ | 10-12h ​  ​| Open reading ​                                     | 
-                                                                                            ​|||| +                                                                                                    ​|||| 
-| Mon          | 23.09. ​ | 10-12h ​           | Open reading ​                                     | +| Mon                           ​| 23.09. ​ | 10-12h ​  ​| Open reading ​                                     | 
-| Tue          | 24.09. ​ | 10-12h ​           Andreas: OrthoDB (BUSCO) ​                         ​+| Tue                           ​| 24.09. ​ | 10-12h ​  ​Gene-tree species-tree reconciliation ​            
-| Wed          | 25.09. ​ | 10-12h ​           | Fabian: Synteny blocks ​                           | +| Wed                           ​| 25.09. ​ | 10-12h ​  ​| Fabian: Synteny blocks ​                           | 
-| Thu          | 26.09. ​ | 10-12 and 13-15h  ​| Jan: Improving Scaffolding ​ / T.B.A. ​(or cancelled  ​+| Thu                           ​| 26.09. ​ | 10-12h   | Jan: Improving Scaffolding ​                       | 
-| Fri          | 27.09. ​ | ---               ​|                                                   |+|                                                  ||| Andreas: OrthoDB ​(BUSCO                         | 
 +|  .                                     ​|| ​ 13-15h ​ | Feedback ​                                         ​
 +| Fri                           ​| 27.09. ​ | ---      |                                                   |
  
-^ Second block ^^^^ +^ Second block (10.–14.02.2020) ​                                                                               |||| 
-|Mon| 10.02.| 10-12h | | +| Mon                            | 10.02. ​ | 10-12h ​ The genome rearrangement landscape ​                        
-|Tue| 11.02.| 10-12h | | +| Tue                            | 11.02. ​ | 10-12h ​ Handling duplications / Small parsimony problem (SPP)      ​
-|Wed| 12.02.| 10-12h | | +| Wed                            | 12.02. ​ | 10-12h ​ Ancestral gene orders in a model-free framework ​           ​
-|Thu| 13.02.| 10-12 and 13-15h | +| Thu                            | 13.02. ​ | 10-12h  | Joint scaffolding ​and ancestral gene order reconstruction  ​
-|Fri| 14.02.| --- | |+| Fri                            | 14.02. ​ 10-12h  ​Student talks                                              ​|
  
  
teaching/2019winter/applcompgenomics.txt · Last modified: 2020/09/14 08:26 by rwittler