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teaching:2019winter:applcompgenomics [2019/09/17 09:11]
rwittler [Table]
teaching:2019winter:applcompgenomics [2020/01/09 12:56]
rwittler [Schedule (draft)]
Line 2: Line 2:
  
 Cedric Chauve -- guest lecturer (Internationales Gastdozentenprogramm)\\ Cedric Chauve -- guest lecturer (Internationales Gastdozentenprogramm)\\
-//​Department of Mathematics,//​\\ +//​Department of Mathematics,//​ 
-//Simon Fraser University, Burnaby, BC, Canada//+//Simon Fraser University, Burnaby, BC, Canada//\\ 
 +cedric.chauve@sfu.ca
  
 === Block seminar === === Block seminar ===
Line 16: Line 17:
 ===== Schedule (draft) ===== ===== Schedule (draft) =====
  
-^ First block                                                                                 ​|||| +^ First block (16.–27.09.2019) ​                                                                       ​|||| 
-| Mon          | 16.09. ​ | 10-12h ​           | Overview: The genomes of 16 Anopheles mosquitoes ​ | +| Mon                           ​| 16.09. ​ | 10-12h ​  ​| Overview: The genomes of 16 Anopheles mosquitoes ​ | 
-| Tue          | 17.09. ​ | 10-12h ​           | Data quality ​                                     | +| Tue                           ​| 17.09. ​ | 10-12h ​  ​| Data quality ​                                     | 
-| Wed          | 18.09. ​ | 10-12h ​           | The //gambiae// phylogeny ​                        | +| Wed                           ​| 18.09. ​ | 10-12h ​  ​| The //gambiae// phylogeny ​                        | 
-| Thu          | 19.09. ​ | 10-12h ​           T.B.A. ​                                           ​+| Thu                           ​| 19.09. ​ | 10-12h ​  ​Use synteny for gene family analysis ​             ​
-| Fri          | 20.09. ​ | 10-12h ​           | Open reading ​                                     | +| Fri                           ​| 20.09. ​ | 10-12h ​  ​| Open reading ​                                     | 
-                                                                                            ​|||| +                                                                                                    ​|||| 
-| Mon          | 23.09. ​ | 10-12h ​                                                             ​+| Mon                           ​| 23.09. ​ | 10-12h ​  ​Open reading ​                                     ​
-| Tue          | 24.09. ​ | 10-12h ​                                                             ​+| Tue                           ​| 24.09. ​ | 10-12h ​  ​Gene-tree species-tree reconciliation ​            
-| Wed          | 25.09. ​ | 10-12h ​                                                             ​+| Wed                           ​| 25.09. ​ | 10-12h ​  ​Fabian: Synteny blocks ​                           ​
-| Thu          | 26.09. ​ | 10-12 and 13-15h ​ |                                                   ​+| Thu                           ​| 26.09. ​ | 10-12h   | Jan: Improving Scaffolding ​                       | 
-| Fri          | 27.09. ​ | ---               ​|                                                   |+|                                                  ||| Andreas: OrthoDB (BUSCO) ​                         | 
 +|  .                                     ​||  ​13-15h ​ | Feedback ​                                         ​
 +| Fri                           ​| 27.09. ​ | ---      |                                                   |
  
-^ Second block ^^^^ +^ Second block (10.–14.02.2020) ​                      |||| 
-|Mon| 10.02.| 10-12h | | +| Mon                            | 10.02. ​ | 10-12h ​   ​
-|Tue| 11.02.| 10-12h | | +| Tue                            | 11.02. ​ | 10-12h ​   ​
-|Wed| 12.02.| 10-12h | | +| Wed                            | 12.02. ​ | 10-12h ​   ​
-|Thu| 13.02.| 10-12 and 13-15h ​| | +| Thu                            | 13.02. ​ | 10-12h  ​  ​
-|Fri| 14.02.| --- | |+| Fri                            | 14.02. ​ 10-12h    ​  ​|
  
  
teaching/2019winter/applcompgenomics.txt · Last modified: 2020/09/14 08:26 by rwittler